Das Kontaktbüro Hochschulen Mecklenburg-Vorpommern soll Kontakte zwischen den Hochschulen sowie anderen wissenschaftlichen und forschenden Einrichtungen in Mecklenburg-Vorpommern und entsprechenden Einrichtungen in Litauen, Estland, Lettland und daran angrenzende Gebiete anbahnen und fördern. Bei der Eröffnung wurde eine gemeinsame Erklärung von DAAD (Deutscher Akademischer Austauschdienst), der Universität Lettlands, der Technischen Universität Riga und dem Bildungsministerium Mecklenburg-Vorpommern unterzeichnet.
Das Büro koordiniert den Austausch von Hochschullehrern, Forschern und Studenten. Der Aufbau und die Pflege von Alumni-Beziehungen gehört ebenso zu den Aufgaben wie die Zusammenarbeit mit anderen deutschen Auslandsvertretungen und Kulturinstitutionen. Darüber hinaus übernimmt das Verbindungsbüro die Aufgaben des Sekretariats für das International Research Council des Landes Mecklenburg-Vorpommern.
Das Kontaktbüro Hochschulen Mecklenburg-Vorpommern wurde im Rahmen des Deutsch-Baltischen Hochschulkontors des Deutschen Akademischen Austauschdienstes (DAAD) eingerichtet. Neben einem DAAD-Informationszentrum gibt es hier außerdem ein Zentrum für deutsche Geschichte, Sprache und Kultur sowie eine gemeinsame Bibliothek, ein Baltisches Zentrum für Germanistik und ein Studienzentrum der Fernuniversität Hagen.